虽说石牌坊结实耐用，但是日久天长也会出现一些问题，天然石材和木材一样是会呼吸的，因此很容易吸收水分或者经由水溶解而侵入污染，如果石牌坊吸收过多的水分和污染就会造成崩裂风化、脱落吐黄以及水斑锈斑等问题，因此应避免用水冲洗或者用过湿的拖把清洗石牌坊的表面。
所有的石牌坊都怕酸碱，因为酸会造成石材中硫铁矿物氧化而产生吐黄的现象，碱也会侵蚀石材以造成晶粒剥离的现象，因此酸碱是破坏石牌坊镜面的原因。市面上的蜡有亚克力蜡、油性蜡以及水性蜡等，这些蜡基本上都会含有酸碱物质，不但会堵塞石牌坊呼吸的毛细孔，还会沾上污尘形成蜡垢，从而使石牌坊表面产生黄化的现象。
为了保证石牌坊石材的呼吸顺畅，应避免在石牌坊表面上长期覆盖地毯以及杂物，否则石材内部的湿气无法通过毛细孔挥发出来，可能还会因湿气过重、含水量增高而产生恼人的病变问题，如果一定要铺设地毯以及堆置杂物的话就要经常更动以便彻底保持干净清洁。
